Komplo teorilerinin esas unsuru yani ortaya çıkma nedeni gizli devlet kuruluşlarıdır. Ufolog William L. Moore’a göre Amerikan Başkanı Harry Truman’ın başkanlığında kurulan Majestik-12 gizli bir devlet kuruluşuydu ve bu birimin amacı dünya dışı canlılarla ilgilenmekti. Fakat bazıları Moore’un sahte bilgilere dayanarak böyle bir şey iddia ettiğini söylüyorlardı ve de böyle bir departman asla olmamıştı.
Uzayla bağlantılı olan bir diğer örgüt ise aydınlanmış olanlardır. Bu organizasyon hakkında yüzlerce teori üretilmişti, ve bazıları bu organizasyona diğer tüm gizli kuruluşların rapor verdiğini iddia etmektedir. Bu listedeki teorilerin ikincisi ise bu organizasyonda yer alanların Dünyamızın dışından gelenler ile insanoğlunun bir karışımı olan bir canlı türünün torunları olduğu yönündedir. Bu teoriye göre, bu melez nesilden gelenler kimliklerini gizleyerek Dünyanın tüm ülkelerinde önemli devlet görevlerine geldikleridir. Ve bunların amaçlarının Dünya’yı yavaş yavaş Dünya dışından gelecek canlıların koloni oluşturmasına hazırlamaktır. Şüpheciler delillerin yetersiz olduğundan ve böyle bir organizasyonun olmadığından söz ederler. Fakat inananlar ise aydınlanmış olanların çok etkin çalıştıklarını ve arkalarında hiçbir kanıt bırakmadan çalıştıklarını söylüyorlar.